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Perfil del Puesto
Se ofrece un contrato de trabajo de duración determinada para un/una bioinfomático/a, debe ser titulado/a superior (Licenciatura o Grado + Máster). El contrato está enmarcado dentro del proyecto MePRAM de medicina de precisión contra la resistencia a antimicrobianos, y el/la candidato/a desempeñaría su tarea dentro del WP2: "Diagnóstico precoz y predictivo basado en la información genómica del microorganismo y metagenómica de la microbiota." y más concretamente en el objetivo destinado a la detección de elementos genéticos móviles asociados a cepas patogénicas, clones de alto riesgo y multi-resistentes. La contratación se formalizará mediante un contrato de duración determinada encuadrado dentro del proyecto "La medicina de precisión contra la resistencia a antimicrobianos: Proyecto MePRAM", nº de expediente PMP22/00092, siendo su responsable en el centro Mª Carmen Fariñas. Este proyecto pertenece a la convocatoria para el año 2022 de concesión de subvenciones a Proyectos de Investigación de Medicina Personalizada de Precisión de la Acción Estratégica en Salud 2021-2023, bajo el PERTE para la Salud de Vanguardia y con cargo a los fondos europeos del Plan de Recuperación, Transformación y Resiliencia., y está financiado por el Instituto de Salud Carlos III.
Provincia
CANTABRIA
Tipo de contrato
Duración determinada programa PRTR
Financiación
Fondos Externos
Jornada completa
Si
Horas semanales
37,50
Salario
29.391,83 €
Categoría Profesional
Titulado Superior
Titulación requerida
Titulado/a superior: Grado en Bioinformática o Biotecnología + Máster en Bioinformática (MECES 3)
Id Perfil
Para realizar este trabajo el/la candidato/a deberá emplear herramientas de secuenciación de genoma completo de tercera generación (ONT), análisis bioinformático de dichas secuencias y generación de bases de datos de clones de alto riesgo y sus elementos genéticos móviles asociados. El candidato o candidata deberá tener, además un manejo fluido del inglés para poder colaborar en la publicación de resultados en revistas científicas.
Experiencia requerida
Grado en Bioinformática o Biotecnología (indispensable). Máster en Bioinformática (indispensable). Formación en Python, R y BASH aplicados a la bioinformática (12.5). Formación en Machine learning (12.5). 1 año de experiencia en laboratorios de genómica microbiana (12.5). Manejo de secuencias clínicas bacterianas y virales (12.5).
Otros conocimientos
Experiencia en herramientas de análisis de secuencias virales y/o bacterianas en línea de comandos. Experiencia en análisis de plásmidos y/u otros elementos genéticos móviles en línea de comandos. Experiencia en el desarrollo de pipelines empleando herramientas como Nextflow/Snakemake. Experiencia en desarrollo de software usando sistemas de control de versiones como Git. Publicación de resultados en revistas científicas.
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