Id Perfil

3373

Perfil del Puesto

Perfil bioinformático/a para el desarrollo y mantenimiento de una plataforma de bioinformática en el campo de las enfermedades infecciosas.

Provincia

MADRID

Tipo de contrato

Indefinido

Financiación

Subven.Nom

Jornada completa

Si

Horas semanales

37,50

Salario

30.272,15 €

Categoría Profesional

Titulado Superior

Titulación requerida

Licenciatura o Grado en áreas de Ciencias de la Salud (Biología, Bioquímica, Farmacia, Medicina), Bioinformática, Ciencias computacionales o Estadística + Máster (MECES 3)

Id Perfil

Desarrollo, puesta en funcionamiento de un clúster de alta computación (HPC). Desarrollo, mejora y puesta a punto de herramientas y pipelines para el análisis de datos masivos de nuevas tecnologías de secuenciación de ADN y/o ARN que permitan realizar un soporte a los investigadores de CIBERINFECT. Desarrollo y puesta en funcionamiento de un portal web que facilite el acceso al repositorio de genomas recogidos para la vigilancia genómica y epidemiológica de las diferentes infecciones, y que incluya herramientas de análisis, explotación y visualización de los datos.

Experiencia requerida

En caso de licenciatura que no sea bioinformática, se requiere que tenga formación post-grado específica (máster en bioinformática). Experiencia en el análisis de datos procedentes de tecnologías NGS (genómicos, transcriptómicos y metagenómicos) en microbiología. Familiaridad en el manejo de herramientas de bioinformática. Dominio del entorno Linux. Conocimientos de al menos uno de los siguientes lenguajes de programación: Bash,Python, R.

Otros conocimientos

Se valorará favorablemente:

• Experiencia en el uso y/o desarrollo de pipelines con Nextflow.
• Conocimiento en el uso de “package managers”: Anaconda, Singularity, Docker.
• Experiencia en el uso de gestores de trabajo en entornos de computación de alto rendimiento: Slurm, Sun Grid Engine (SGE).
• Experiencia en el uso de software para el control de versiones (GitHub, GitLab, etc). Se valorará positivamente si el candidato facilita su usuario de GitHub.
• Nivel alto de inglés oral y escrito.